Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMS1Q86UR5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RIMS1Q86UR5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RIMS1Q86UR5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RIMS1Q86UR5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RIMS1Q86UR5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RIMS1Q86UR5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RIMS1Q86UR5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RIMS1Q86UR5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RIMS1Q86UR5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms