Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHA9Q7RTU4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms