Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RSBN1Q5VWQ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSBN1Q5VWQ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms