Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
C12orf60Q5U649 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms