Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRT3Q5FWE3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRT3Q5FWE3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms