Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNI3KQ59H18 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms