Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SS18Q15532 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SS18Q15532 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18Q15532 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18Q15532 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18Q15532 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18Q15532 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18Q15532 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18Q15532 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214 ms