Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL19A1Q14993 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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