Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARB2Q14108 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARB2Q14108 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARB2Q14108 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARB2Q14108 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARB2Q14108 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARB2Q14108 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARB2Q14108 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARB2Q14108 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARB2Q14108 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARB2Q14108 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARB2Q14108 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARB2Q14108 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARB2Q14108 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCARB2Q14108 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARB2Q14108 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCARB2Q14108 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARB2Q14108 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARB2Q14108 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARB2Q14108 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARB2Q14108 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARB2Q14108 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCARB2Q14108 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARB2Q14108 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARB2Q14108 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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