Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTAN1Q13813 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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