Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPP2Q13103 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPP2Q13103 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms