Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRJQ12913 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRJQ12913 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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