Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CGNL1Q0VF96 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms