Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDSPL2Q05D32 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTDSPL2Q05D32 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms