Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms