Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms