Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVS71-1P61550 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms