Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP11P51784 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP11P51784 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP11P51784 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP11P51784 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP11P51784 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP11P51784 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP11P51784 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP11P51784 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP11P51784 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP11P51784 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP11P51784 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP11P51784 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP11P51784 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP11P51784 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP11P51784 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP11P51784 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP11P51784 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP11P51784 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP11P51784 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP11P51784 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP11P51784 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP11P51784 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP11P51784 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP11P51784 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP11P51784 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP11P51784 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP11P51784 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP11P51784 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP11P51784 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP11P51784 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP11P51784 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP11P51784 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP11P51784 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP11P51784 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP11P51784 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP11P51784 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP11P51784 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP11P51784 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP11P51784 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP11P51784 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP11P51784 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP11P51784 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP11P51784 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP11P51784 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP11P51784 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP11P51784 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP11P51784 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP11P51784 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP11P51784 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP11P51784 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP11P51784 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP11P51784 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP11P51784 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP11P51784 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP11P51784 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP11P51784 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP11P51784 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP11P51784 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP11P51784 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP11P51784 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP11P51784 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP11P51784 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP11P51784 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP11P51784 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP11P51784 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP11P51784 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP11P51784 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP11P51784 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP11P51784 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP11P51784 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP11P51784 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP11P51784 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP11P51784 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms