Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD8P48556 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD8P48556 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms