Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4A3P38919 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms