Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOCP08134 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOCP08134 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOCP08134 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOCP08134 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOCP08134 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOCP08134 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOCP08134 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOCP08134 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOCP08134 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOCP08134 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOCP08134 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOCP08134 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOCP08134 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOCP08134 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOCP08134 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOCP08134 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOCP08134 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOCP08134 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOCP08134 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOCP08134 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOCP08134 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOCP08134 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOCP08134 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOCP08134 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOCP08134 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOCP08134 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOCP08134 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOCP08134 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOCP08134 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOCP08134 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOCP08134 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOCP08134 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOCP08134 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOCP08134 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOCP08134 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOCP08134 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOCP08134 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOCP08134 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOCP08134 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOCP08134 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOCP08134 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOCP08134 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOCP08134 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOCP08134 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOCP08134 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOCP08134 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOCP08134 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOCP08134 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOCP08134 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOCP08134 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOCP08134 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOCP08134 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOCP08134 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOCP08134 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOCP08134 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOCP08134 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms