Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPP01282 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPP01282 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPP01282 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPP01282 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPP01282 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPP01282 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPP01282 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPP01282 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPP01282 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPP01282 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPP01282 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIPP01282 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIPP01282 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPP01282 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPP01282 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPP01282 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPP01282 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPP01282 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPP01282 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPP01282 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIPP01282 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIPP01282 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIPP01282 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIPP01282 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPP01282 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPP01282 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPP01282 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPP01282 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPP01282 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPP01282 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPP01282 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPP01282 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPP01282 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPP01282 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPP01282 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPP01282 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPP01282 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPP01282 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPP01282 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPP01282 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPP01282 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPP01282 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPP01282 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPP01282 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPP01282 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPP01282 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPP01282 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPP01282 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPP01282 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPP01282 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPP01282 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPP01282 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPP01282 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPP01282 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPP01282 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPP01282 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPP01282 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPP01282 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPP01282 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPP01282 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPP01282 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPP01282 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPP01282 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPP01282 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPP01282 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPP01282 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPP01282 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPP01282 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPP01282 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPP01282 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPP01282 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms