Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RECQL4O94761 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQL4O94761 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms