Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCO2O43819 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCO2O43819 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCO2O43819 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCO2O43819 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCO2O43819 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCO2O43819 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCO2O43819 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCO2O43819 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCO2O43819 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCO2O43819 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCO2O43819 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCO2O43819 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCO2O43819 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCO2O43819 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCO2O43819 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCO2O43819 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCO2O43819 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCO2O43819 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCO2O43819 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCO2O43819 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCO2O43819 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCO2O43819 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCO2O43819 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCO2O43819 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCO2O43819 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCO2O43819 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCO2O43819 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCO2O43819 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCO2O43819 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCO2O43819 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCO2O43819 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCO2O43819 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCO2O43819 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCO2O43819 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCO2O43819 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCO2O43819 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCO2O43819 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCO2O43819 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCO2O43819 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCO2O43819 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCO2O43819 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCO2O43819 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCO2O43819 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCO2O43819 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCO2O43819 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCO2O43819 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCO2O43819 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCO2O43819 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms