Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZK1P1A8MUH7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1P1A8MUH7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms