Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSTM2BA6NLU5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2BA6NLU5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VSTM2BA6NLU5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VSTM2BA6NLU5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VSTM2BA6NLU5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM2BA6NLU5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms