Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POTEMA6NI47 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEMA6NI47 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms