Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms