Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms