Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT2

UBA2, SUMO-activating enzyme subunit 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA2Q9UBT2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBA2Q9UBT2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBA2Q9UBT2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBA2Q9UBT2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBA2Q9UBT2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBA2Q9UBT2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBA2Q9UBT2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBA2Q9UBT2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBA2Q9UBT2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBA2Q9UBT2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBA2Q9UBT2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBA2Q9UBT2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA2Q9UBT2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms