Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms