Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC4Q9NTJ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms