Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC4BQ9NT99 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC4BQ9NT99 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC4BQ9NT99 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms