Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE3

NOP10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP10Q9NPE3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOP10Q9NPE3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NOP10Q9NPE3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms