Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms