Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GORASP1Q9BQQ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms