Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY1Q96T51 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms