Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERGIC2Q96RQ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERGIC2Q96RQ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERGIC2Q96RQ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERGIC2Q96RQ1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERGIC2Q96RQ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERGIC2Q96RQ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERGIC2Q96RQ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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