Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35A4Q96G79 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms