Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms