Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAF3

WDR48, WD repeat-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48Q8TAF3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR48Q8TAF3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
WDR48Q8TAF3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR48Q8TAF3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms