Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM139Q8IV31 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM139Q8IV31 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms