Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms