Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRT3Q5FWE3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms