Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PROX2Q3B8N5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms