Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SSX2Q16385 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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