Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC1Q15915 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC1Q15915 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms