Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIGQ13278 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIGQ13278 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIGQ13278 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIGQ13278 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RIGQ13278 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIGQ13278 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIGQ13278 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIGQ13278 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIGQ13278 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIGQ13278 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIGQ13278 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIGQ13278 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIGQ13278 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIGQ13278 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIGQ13278 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIGQ13278 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIGQ13278 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIGQ13278 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIGQ13278 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIGQ13278 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIGQ13278 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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