Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3FQ13275 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3FQ13275 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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