Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC37.66■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
GRIN2AQ12879 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2AQ12879 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
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